| 任期 | 姓名 |
| 第八任(113年2月1日~迄今) | 蔡佩舒博士 |
| 代理所長(112年11月26日~113年1月31日) | 賴秉彥博士 |
| 第七任(109年11月26日~112年11月25日) | 賴秉彥博士 |
| 代理所長(109年8月13日~109年11月25日) | 莊琍玲博士 |
| 第六任(108年8月1日~109年8月12日) | 龔慧懿博士 |
| 第五任(105年8月1日~108年7月31日) | 黃玫珍博士 |
| 代理所長(105年2月1日~105年7月31日) | 趙玉芝博士 |
| 第四任(102年2月1日~105年1月31日) | 賴秉彥博士 |
| 第三任(99年4月1日~102年1月31日) | 儲湘君博士 |
| 第二任(98年8月1日~99年3月31日) | 楊淑媖博士 |
| 首任所長(93年8月1日~98年7月31日) | 彭輝榮博士 |